Закон предъявляет особые требования к формированию и деятельности органов управления благотворительных организаций. Во-первых, по смыслу п. 1 ст. 10 Федерального закона «О благотворительной деятельности и благотворительных организациях» управление благотворительной организацией должно осуществляться на коллегиальной основе, ведь высший орган управления ею может быть только коллегиальным. Во-вторых, ограничен круг лиц, имеющих право входить в высший орган управления некоммерческой организации. В силу п. 3 ст. 10 Федерального закона «О благотворительной деятельности и благотворительных организациях» в составе высшего органа управления благотворительной организации не может быть более одного работника ее исполнительных органов.
К исключительной компетенции высших органов управления некоммерческой, в том числе благотворительной, организации относится, в частности, решение вопросов об изменении ее устава, формировании и досрочном прекращении полномочий исполнительных органов некоммерческой организации (п. 3 ст. 29 Федерального закона «О некоммерческих организациях»). Члены высшего органа управления благотворительной организации осуществляют свою деятельность на безвозмездной основе, в качестве добровольцев. На оплату труда административно-управленческого персонала благотворительных организаций не может быть использовано более 20% денежных средств, расходуемых соответствующими организациями в течение финансового года (п. 3 ст. 10; п. 3 ст. 16 Федерального закона «О благотворительной деятельности и благотворительных организациях»).
В благотворительном фонде, помимо органов управления, формируется попечительский совет, осуществляющий надзор за деятельностью фонда, принятием другими органами фонда решений и обеспечением их исполнения, использованием средств фонда, соблюдением им законодательства. Создание попечительского совета фонда обязательно; свою деятельность попечительский совет осуществляет на общественных началах (ст. 7 Федерального закона «О некоммерческих организациях»).
В силу п. 4 ст. 10 закона члены высшего органа управления благотворительной организацией и должностные лица благотворительной организации не вправе занимать штатные должности в администрации коммерческих и некоммерческих организаций, учредителем (участником) которых является эта благотворительная организация. Важной гарантией против злоупотреблений административно-управленческого аппарата некоммерческих организаций является ст. 27 Федерального закона «О некоммерческих организациях», возлагающая на руководителя некоммерческой организации, а также членов высшего органа управления или органа надзора за ее деятельностью определенные обязанности в случае конфликта интересов указанных лиц с интересами некоммерческой организации. В силу п.п. 3, 4 ст. 27 Федерального закона «О некоммерческих организациях» при наличии заинтересованности руководителя, а также членов высшего органа управления или органа надзора за деятельностью некоммерческой организации в сделке, стороной которой является или намеревается быть некоммерческая организация, а также в случае иного противоречия интересов указанных лиц и некоммерческой организации в отношении существующей или предполагаемой сделки, заинтересованное лицо обязано сообщить о своей заинтересованности органу управления некоммерческой организацией или органу надзора за ее деятельностью до момента принятия решения о заключении сделки. Такая сделка должна быть одобрена соответствующим органом. Сделка, в совершении которой имеется заинтересованность, совершенная с нарушением установленных ст. 27 Федерального закона «О некоммерческих организациях» требований, может быть признана недействительной.
