Отдел “Миссия Церковь и медицина” при Священном Синоде Украинской Православной Церкви образован решением Священного Синода от 14 декабря 2007 г. (журнал № 116). Первым председателем Мисии был назначен Преосвященный Лука (Коваленко), епископ Васильковский, викарий Киевской Митрополии.
22 ноября 2008 года решением Священного Синода Украинской Православной Церкви (журнал № 130) председателем Миссии Церковь и Медицина назначен протоиерей Геннадий Батенко